Jan Długosz - słynny kronikarz piszący swoje dzieła w drugiej połowie XV wieku nazywa go Trzennykiem, a w XIX wieku nazywano go Trzcinnikiem. Istnieją dwie wersje tłumaczące obecną nazwę Trzydnika. Najbardziej znana wspomina o pobycie w Trzydniku Jana III Sobieskiego, który miał spędzić w okolicy trzy dni, co rzekomo wpłynęło na dzisiejszą nazwę. Ze źródeł historycznych jednak wiadomo, że wieś nosiła to miano jeszcze przed wizytą monarchy. Druga bardziej prawdopodobna wersja głosi, że nazwa pochodzi od trzcin (Trzcinnik), które bujnie porastały bagna wypełniające liczne zagłębienia terenu.